马上注册,结交更多好友,享用更多功能,让你轻松玩转社区。
您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?立即注册
x
本帖最后由 青菜567 于 2023-9-28 10:41 编辑
, F, w! O4 g! Z) G1 h! t/ w
0 x$ Y3 c$ A( L* X* C% W) M4 V无论就医看病还是体检,做的检查除了仪器检查如B超、CT、核磁共振、胃肠镜外,最多的就是生化检查,如基于血液、尿液、大便、痰液等的检测,因为这些体液中含有众多生物标志物,能够提供关于健康状况和疾病风险的重要信息。
0 u, X% Z1 R5 u% s* U / j9 m4 s% s5 d D e+ x
以血液为例,血液是流动在人的血管和心脏中的一种红色不透明的粘稠液体,负责各类营养物质的输送以及机体产生的废物的排除。血液由血浆和血细胞组成。血浆中含有水、蛋白质和其他溶解物质,血细胞包括红细胞、白细胞和血小板。
: }- { N9 Y% {$ F, `" g
血液中一些指标的异常时常预示着身体某个器官或组织机能受损。目前基于血液的肿瘤早筛技术中经常提到的cfDNA就是血浆中存在的一种分子标志物。 . C! N3 l. J3 h3 k* ]0 w7 H4 T
(参考于网络图片)
4 p2 E2 L- a2 k9 J7 M+ F8 M
: N! ^- A8 k) G1 B7 c如何理解cfDNA和ctDNA? s H$ i. `' Z# G# C' ~
cfDNA全称为cell free DNA即细胞游离DNA,顾名思义就是指游离于细胞外的DNA。那么问题来了,DNA不都是在细胞内吗,怎么会跑到细胞外呢?
# S5 a7 n: ~/ t9 I/ c% ]7 {! ^
人体内的细胞不断更新换代,也就是说每天每时每刻我们体内都不断地有细胞在凋亡,又有新的细胞在形成。在细胞凋亡过程中有些DNA会“破壳而出”进入血液中,另外,人体在外界物理或化学刺激下引发的细胞坏死也会导致DNA释放到血液中,所以我们人体血液中都含有cfDNA。 % m) ]. ] F3 j" E2 n" E( L
(参考于网络图片) . e) M8 P/ ^6 b M- P7 s" M
但对于肿瘤患者来说,其血液中除了含有正常细胞凋亡或坏死释放的DNA外,还包括肿瘤细胞释放的DNA,这部分DNA有个专有名称叫ctDNA,全称为circulating tumor DNA即循环肿瘤DNA。因此对于肿瘤患者来说,血液中的cfDNA包含了ctDNA。 , {% R3 w r, g5 q. V) }- S
ctDNA主要来源于坏死的肿瘤细胞、凋亡的肿瘤细胞、循环肿瘤细胞(CTC)、肿瘤细胞分泌的外排体,其携带与肿瘤发生相关的分子信号,这些分子信号如同肿瘤的“身份指纹”,对肿瘤早筛、肿瘤精准治疗都具有非常重要的意义。 6 `2 {* i0 ^7 O5 r8 e2 {
cfDNA全基因组测序肿瘤早筛技术 # k" w8 d2 g+ x7 d7 q; _- b- H
通过上面我们了解了cfDNA和ctDNA的概念和区别,那么对于肿瘤早筛来说,到底检测的是cfDNA上的哪些信息?也就是哪些信息是与肿瘤的早期发生相关呢?这个需要经过临床研究进行标志物的筛选和验证。
+ |( @0 |% M) C8 O
和瑞基因研发团队通过临床研究发现,仅需受检者10ml静脉血,通过全基因组测序技术(WGS, Whole Genome Sequencing)和自主研发的机器学习算法,在全基因组范围内分析四个维度的特征提取及模型构建,包括末端序列、片段大小分布、核小体印迹、拷贝数变异,可精准评估六大高发高危癌种风险,包括肺癌及五大消化系统癌种(食管癌、胃癌、肝癌、胰腺癌、结直肠癌),并可准确溯源癌症风险器官。
% n! ]0 B, g# }4 Z2 l
那么如何理解四个维度呢? ! s8 q( Y. F* L! |
片段大小: A7 D& |4 i1 n( m0 H
2 F( k7 e- q x
DNA片段大小以核苷酸碱基对的数量表示,以bp为单位。肿瘤细胞释放的ctDNA片段大小比正常细胞释放的cfDNA更短。 + I5 I; j+ R! X5 ^# x" |
末端序列
* D: ]: Y% `8 B( g4 I! ?在DNA片段化进入血液过程中,DNA发生了非随机断裂,其末端的几个核苷酸,癌与非癌具有不同偏好的末端切割模式。
/ t5 ^% q! V- f
3 s/ W% o" h1 w8 Q0 \5 N 核小体印迹+ Q7 c; g# A- x# h9 [6 ]) ]% F$ @
- S; I, I+ D+ G2 s. E肿瘤发生和发展的内因是原癌基因的活化和/或抑癌基因的失活等异常表达,而核小体印迹的松散程度可代表基因表达活跃程度的高低。 3 K8 r& I; t/ T% Q8 n) r, U
拷贝数变异9 M7 u9 c3 ]6 O) P) p/ F
& o+ a. F" G* o) k! F6 j% _肿瘤组织通常存在拷贝数变异等染色体异常现象,而正常组织基本无此现象。
6 ^9 I! c8 F% a) `. k
(可点击图片放大查看)
6 _% }! g% i) R3 A: G9 o$ [
( Z0 A1 \8 F# p1 U5 M7 n- r |