癌症血液基因检测真的靠谱吗？15000例样本来说话

                                                                           血液检测癌症又向前迈进一大步

      循环肿瘤细胞是指从肿瘤上脱落并进入循环系统的癌细胞，可以通过简单的血液检测来发现。最终实现通过对病人抽血来监测他们对癌症治疗的反应。
3月23日的Nature Communication上报道了加州大学伯克利分校的研究人员通过检测属于循环系统中肿瘤细胞上的蛋白，在这方向上迈出了重要的一步。
研究重点是循环肿瘤细胞，这些细胞是从原发肿瘤中分离出来的，并在血液中进行循环，也就是癌症扩散的元凶。研究这种细胞非常不容易，因为它们非常罕见，即使从血液中富集，能够提取到的微乎其微。与原发肿瘤相比，它们的构成蛋白质是不相同的，研究人员正在揭开这些难以捉摸的秘密。

     集成微流体系统和荧光探针
     为了更好地研究恶性肿瘤细胞的循环，研究人员与工程师合作开发一个微流体系统，把集中的样本的细胞进行分离，之后研究每一个分离细胞中蛋白质的作用。科学家们通过引入荧光探针来识别肿瘤蛋白，并与特定的蛋白靶点结合。通过对蛋白质靶标的分类和探测，该测试比现有的病理工具更具选择性。
这个测试可以从乳腺癌患者的血液中分离出循环肿瘤细胞，之后然后使用微尺度物理学来为蛋白质生物标记物设计精准测试，在分离单个细胞之后，微流体装置会破碎细胞，测试细胞内容物中的8个癌症蛋白质生物标记。研究人员正在不断扩大可测蛋白的数量，这样的话，病理学家就可以通过标记物更加精确地分析病情。

    研究人员介绍该发明
    伯克利的生物工程教授、该研究小组的领导人Amy Herr说：“微流体设计是本研究的关键。我们能够将每个测试阶段所需工艺整合成一个。系统集成使我们能够非常迅速地完成每一个测量步骤，而生物标志物仍然是浓缩的。如果不异常快地执行，细胞的蛋白质会扩散而检测不到。”
Herr总结：“使用液体活检分析细胞中的DNA和RNA的方法已经取得了很大的进步，我们将这一技术再次扩展到对蛋白的高选择性的检测。我们正在努力创造一种检测方法，允许医生通过抽血来监测病人的治疗反应，可以每天都进行。
     2017-03-28 生物探索

恐怕还需要前提条件。也就是全血基因检测的时间，是在未服用靶向药之前。否则，会由于靶向药的作用，大大减少相关脱落细胞。我妈就是在吃了易瑞沙和9291之后检测的，全阴。

重磅：华人科学家在外泌体液体活检领域取得重大突破
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   近日，普渡大学陶纬国（W. Andy Tao）教授团队在癌症的液体活检领域做出了「突破性贡献」，他们通过分析血液中囊泡（extracellular vesicles，EVs；包括近几年颇受业界关注的外泌体在内）内的磷酸化蛋白，实现了检测癌症的目的。本月初，著名期刊《美国科学院院报》刊登了陶教授团队的这一重要研究成果(1)，研究的第一作者是来自宝岛台湾的I-Hsuan Chen。
   
陶纬国（W. Andy Tao）教授
    让奇点糕感到意外的是，中科院上海植物逆境生物学研究中心主任，普渡大学杰出教授，著名植物生物学家朱健康教授也是本研究的通讯作者之一。朱健康教授参与了本研究的设计和数据分析。

朱健康教授
    一说起液体活检，大多数人第一个想到的是循环肿瘤DNA（ctDNA）检测。就在20天前，癌症早筛公司GRAIL终于拿到了巨额B轮融资中的9亿美元，在业界引起极大的轰动。估计2017年国内从事ctDNA检测的公司的估值又要暴涨了。
基于ctDNA的液体活检已经很牛了，磷酸化蛋白检测又是啥？它凭什么重要？
蛋白的磷酸化是生命活动中非常重要的一个环节，细胞的生长、分裂和死亡都多多少少和它有关。简单说，磷酸化就是控制蛋白的开关，给特定的蛋白加个磷酸基团，蛋白就被活化了，能工作了；相对应的去磷酸化，就是把加在蛋白上的磷酸集团去掉，让蛋白失活。在这一开一关之间，决定了细胞的很多生命活动是不是进行，以及往哪儿进行。

本研究一作I-Hsuan Chen
     对于癌症而言，如果那个控制细胞生长的蛋白被大量磷酸化了，细胞就开启疯长模式，癌症就发生了。所以现在有很多药物是抑制关键蛋白磷酸化的，例如经常挂在医生嘴边的易瑞沙、特罗凯和AZD9291等。
因此，通过检测身体蛋白磷酸化状态来检测癌症，看上去是靠谱的，但是据普渡大学报道，截止陶教授的这篇论文发表前，学界都认为通过血液检测磷酸化蛋白是不太现实的，原因是肝脏在源源不断的往血液中释放磷酸酶，已经磷酸化的蛋白到了血液，它的磷酸都被搞掉了，没办法检测了。
为了解决这个问题，陶教授团队将目光盯在了近几年非常热的囊泡上。这些囊泡都是从不同的细胞上分离出来的小泡泡，它们携带着母细胞的DNA、RNA和蛋白质等信息，通过分析小泡泡可以直接获得母细胞的基本信息。由于血液中散布的囊泡有一层膜保护，因此它们非常稳定，基本不受外界环境的干扰。所以陶教授认为，囊泡里面的磷酸化蛋白也不会受到血液中去磷酸化酶的干扰。

    于是陶教授团队从Indiana Biobank收集了保存了5年（有研究表明30年「陈酿」的血样里的外泌体还可以用于分析研究）的30个乳腺癌患者血样，和6个健康人的血样。他们分离出血液里面的微囊泡和外泌体，利用质谱分析蛋白磷酸化状况。最终他们累计找到了近10000个磷酸化的蛋白，其中有144个磷酸化蛋白在乳腺癌患者血样囊泡中的量显著高于健康人。
显然，陶教授团队的初步研究表明，囊泡里的磷酸化蛋白具有作为癌症标志物的潜力，「这个研究肯定是一个突破，说明用囊泡中的磷酸化蛋白检测癌症是可行的。」
普渡大学癌症研究中心主任Timothy Ratliff说，这项研究结果有望用于癌症的早期检测和疗效及复发监测，「所有的癌细胞都会分泌微囊泡和外泌体，所以这个检测方法具有普遍适用性，只不过在不同的癌症类型中，磷酸化蛋白的类型可能有所不同。」这件事情也是陶教授团队目前在研究的。此外，陶教授和Anton B. Iliuk联合创办的公司Tymora Analytical Operations也在开发适合临床使用的更简单的检测方法。
近年来，外泌体领域的研究颇受关注，而且转化极快。例如Codiak BioSciences公司。2015年6月，Codiak的科学创始人、安德森癌症中心癌生物学主任Raghu Kalluri在《自然》上刊文称(2)，胰腺癌癌细胞外泌体中包含的一种蛋白有可能可以作为一种非侵入性诊断和筛查处于适合手术治疗阶段的早期胰腺癌。5个月之后，Codiak获得8000万美元启动资金，宣布成立。业界对外泌体寄予的厚望可见一斑。

     与传统的组织活检相比，ctDNA和CTC（循环肿瘤细胞）检测是无创检测，患者接受度更高，可以很好的解决肿瘤的异质性问题，还可以动态监测。但是它们面临的问题是在血液里含量太少，难以获取；外泌体在血液中是相当丰富。这一点尤其是体现在癌症的早期，血液中几乎没有ctDNA和CTCs，但是肿瘤不管任何时候都在分泌外泌体等囊泡。这给癌症的早期筛查带来了极大的想象空间。
       来源：  生物探索

我妈肺腺癌四期，因没法穿刺做基因检测，医生说血液的不准，建议化疗。今天刚结束第三疗程，担心对身体伤害太大，下阶段打算盲试易瑞沙看看效果。

nogamze33 发表于 2016-7-26 13:55
希望有知道的可以提供ctDNA检测单位和价格，供大家参考，谢谢！

现在一般多用的是华大、燃石和世和，如果是全基因检测基本在16,000左右，单用外周血的话价格会低很多，具体可以联系基因检测机构询问~

                                                谈癌症！26000名科学家告诉你未来
   
    最近，约26000名科学家和医生聚集在华盛顿，共同讨论了一件事件——癌症。每年美国癌症研究协会（AACR）都会召集世界各地的大咖来分享各自的研究进展。那么，今年AACR年会又呈现了哪些令人兴奋的研究成果？科学家们的最新抗癌思路又是什么？
1抓住血液里的信息

    对许多癌症患者来说，血液样本不仅仅是血细胞。随着癌症的发展，它可以在血液中释放各种不同物质，包括肿瘤细胞、肿瘤DNA、RNA以及细胞外胞囊。如今科学家们可以通过分析这些物质来了解肿瘤的基本生物学和遗传学，这种方式也被称为液体活检。如今，科学家们已经开发了多种不同形式的液体活检。

    美国斯坦福大学的Max Diehn博士表示，与传统的扫描检测相比，基于ctDNA的液体活检能够早6个月检测到肺癌的复发迹象，这给治疗提供了潜在的机会。

    美国约翰霍普金斯大学的Victor Velculescu博士建议，使用ctDNA来追踪免疫疗法药物的疗效，这对癌症治疗具有重要的意义。

    虽然该领域正在迅猛发展，但进入临床之前仍然需要克服一些障碍。例如，血液中的癌细胞以及ctDNA的量很少，获取这些物质存在一定的困难，因而科学家们需要不断地提高检测的灵敏度。此外，剑桥学院的Carlos Caldas教授指出，好比打开模糊的电台，过多的背景“噪音”可能会淹没了信号，使科学家的分析难度更加大。

    同样来自剑桥学院的Nitzan Rosenfeld博士建议，从液体活检中获取更多信息的关键是扩大血液中搜索多种肿瘤标志物的网络，而不是集中在一种标志物上。如何更好地大海捞针？答案就是寻找多个针！

2把握微生物——不仅仅是细菌

    人体内含有细菌，它们可以帮助机体产生一系列的功能，如分解食物和制造荷尔蒙。另外，细菌似乎在癌症治疗中也发挥着作用，在某些情况下可能还会影响治疗的成功性。

    关于这个话题，来自法国古斯塔夫鲁西研究所的Laurence Zitvogel教授分享了成果。她的研究结果表明，肠道微生物可以用来区分哪些人会对免疫治疗药物有反应，以及哪些人不会对此作出反应。

    通过观察肺癌和肾癌患者，她发现白细胞抵抗两种特殊肠道细菌的患者，接受免疫疗法后倾向于具有较好的生存率。她还发现，在免疫疗法之前或之后给予抗生素，患者的存活率往往较差。

    这项研究在会议上引发了争论，因为对一些患者来说，抗生素可能有助于对抗危及生命的感染。但这些研究结果也增加了通过操纵肠道微生物来提高治疗效果的另一种可能性。这种想法需要进一步研究，不过以色列魏茨曼研究所的Eran Sega教授对此表示支持，他长期探索微生物与个体化癌症治疗。
3利用组合疗法的力量

   一旦开发一种药物，往往需要大量的修正来解决如何从中获得更好的结果。通常，不同的治疗组合往往比单一疗法效果更加强大。例如在免疫治疗领域，英国皇家马斯登医院的James Larkin博士展示了一个例子：在晚期黑色素瘤3期临床试验中，两种免疫疗法药物ipilimumab (Yervoy)和nivolumab (Opdivo)的组合比分开单独使用的效果更好，但是联合治疗带来的副作用挑战更大。

    其他不同的研究者表明，免疫治疗也可以与其他现有药物相结合使用，这种组合方式也显现出了一些早期的积极效果。另外，还有科学家尝试着与抗癌病毒的组合疗法。

    正如两种药物可能比一种更好，“两人智慧胜一人”这句格言似乎特别贴切癌症的研究进展。美国前副总统拜登曾在谈话中表示，“几十年来，我们以为可以在一门学科中一次性解决癌症。但这不是癌症的运作方式，这就是为什么我们必须结合每一门学科，我们开始以更协调的方式来对抗癌症，合作可以成倍地增加解决问题的机会。”

4巧用基因编辑对抗癌症

    在科学新闻中，CRISPR常常占据头条，AACR会议也不例外。这个创新技术的项目数量表明，越来越多的实验室在使用CRISPR，并且理由也越来越充分。

    CRISPR能够帮助科学家们揭开癌症的遗传和分子基础，增强人们对疾病发展的理解。例如Broad研究所的Achilles项目，他们在癌症细胞中使用CRISPR技术以拆开癌细胞的坚韧性，未来这些成果可以用来开发针对癌症弱点的新疗法。

     虽然这可能是CRISPR技术在癌症研究中最常见的应用之一，但这并不是唯一的。科学家们还展示了该系统的不同用途。例如，美国国家癌症研究所的Louis Staudt博士一直在利用CRISPR来探索为何有些淋巴瘤患者对靶向药物ibrutinib有非常好的反应。他们现在可以将某种特殊的淋巴瘤分为不同的组，这样有助于指导治疗。

    无论是液体活检、微生物、组合治疗还是基因编辑，科学家们都有着不同的策略，但是他们有着一个共同的目标：更快地击败癌症！

End
参考资料：Blood tests, microbes, immunotherapy and more: AACR 2017’s hottest topics

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重大突破！癌症“照妖镜”来了，每8分钟或挽救一条生命！
　　有这样一串冷冰冰的数字：2015年，我国新增429.2万癌症患者，癌症死亡病例达到281.4万，很多人因此谈癌色变。2015年我国新增的癌症病例大约是430万，死亡的是280万，也就是平均每分钟新增的癌症患者已经超过8人。然而，另一个更加痛心的事实是，早期的癌症没有明显症状，往往到了晚期才被发现。
　　如何及时发现癌症？这一个新的世界性课题，一直困扰着国内外医学界。然而，这支中国医疗团队，发明的一款“照妖镜”，可让癌症早早现出原形，挽救成千万人的生命！
　　癌症“照妖镜”来了，一滴血可测癌症！
　　早癌九成可治，晚癌九死一生。肿瘤具有隐秘性，早期的肿瘤虽然好治愈，可是由于没有明显症状，往往到了晚期才容易被人发现。而晚期的肿瘤已经转移、扩散，很难医治。
　　事实上早在1989年，学术界就发现了人体中的热休克蛋白90α可以成为肿瘤发现的标志物，二十多年以来，世界各国的研究团队已经围绕这个蛋白，但迟迟没有研究成果转化为产品。
　　2009年，清华大学生命科学学院罗永章教授的团队开始介入研究，并通过重组蛋白质大规模制备技术，人工制备出了结构稳定的热休克蛋白90α。这相当于他们可以自由“制造”这种蛋白。在此基础上，他们还自主研发出了一种专门检测热休克蛋白90α的试剂盒。患者只需取一滴血，即可用于癌症病情监测和治疗效果评价。
　　目前，我国自主研发的Hsp90α定量检测试剂盒已通过临床试验验证，获得国家第三类也是最高类别的医疗器械证书，并通过欧盟认证，获准进入中国和欧盟市场。
　　虽然癌症“照妖镜”已经获得国家许可，但这种检测热休克蛋白90α的试剂盒只是一种实验室产品，要想让它服务千百万患者必须实现它的产业化，这个过程还有一段很长的路要走。

记录老龙 发表于 2017-4-30 17:32

                               
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之前听过罗永章讲课，他们公司生产比较的药，但是种种原因推不出来。貌似他为了媳妇才留在中国，要么要把他的研究在国外推出来了。我常识联系他的秘书买药，没下文，哎

ASCO2017：通过血浆cfDNA对神经母细胞瘤进行无创分析具有可行性
导读
         神经母细胞瘤(NB)是儿童中最常见的颅外实体瘤。尽管有多种治疗方式，但是高危NB的5年存活率不到50%。最近的研究显示，与诊断样本相反，复发性NB肿瘤由于克隆演变而具有更显著的高突变负担，这为个性化疗法的发展和复发时进行分子分析带来了挑战。然而，复发时并不总是可以获得肿瘤样本。
关键字：  肿瘤 | 细胞瘤 | ASCO
        神经母细胞瘤(NB)是儿童中最常见的颅外实体瘤。尽管有多种治疗方式，但是高危NB的5年存活率不到50%。最近的研究显示，与诊断样本相反，复发性NB肿瘤由于克隆演变而具有更显著的高突变负担，这为个性化疗法的发展和复发时进行分子分析带来了挑战。然而，复发时并不总是可以获得肿瘤样本。来自纽约Memorial Sloan Kettering癌症中心的研究人员评估了复发时使用游离DNA(cfDNA)无创地表征肿瘤谱以鉴定可靶向的遗传变异体的可行性。
        在多种治疗期间，研究人员从10例高危4期NB患者中收集了肿瘤标本、血浆和匹配的对照样品。使用MSK-IMPACT平台分析样品，该平台采用靶向深度测序法，用于研究410个可操作基因的外显子和选定的内含子。在诊断、疾病进展或复发期进行的手术中收集肿瘤标本。在疾病进展期收集血浆样品，收集肿瘤后平均395天(47-1597天)。匹配的对照样品用于过滤种系变种。
        结果显示，分别从10/10例患者的肿瘤组织和6/10例患者的cfDNA中检测到体细胞突变和拷贝数变异。这些包括复发性NB的驱动因素，如MYCN扩增和ATRX突变。在4例患者中，cfDNA还检测到原始肿瘤标本中未检测到的体细胞突变，包括NRAS、MLL2、CIC和IDH2中的潜在可靶向突变(最近的报道发现它们在复发环境中富集)，以及与预后不良相关的ARID1B突变。
        本研究表明，通过血浆cfDNA分析对NB的动态遗传异质性进行无创分析是可行的。这种分析可以潜在地补充肿瘤分析，特别是在复发环境中，用以指导治疗计划。该研究结果要求在临床试验中纳入cfDNA分析，以进一步评估其对NB患者临床管理的效果。
        整理自ASCO2017年度会议论文集

                 来源：艾兰博曼医学网

西湖水 发表于 2016-10-18 11:28
我家是在今年的四月份做的，当时担心血液检测的准确度，也做了组织样本的检测，两份样本的检测结果一至。
...

请问你家人做的时候在吃靶向药吗？另外做的是哪种检测？谢谢告知！